Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vav3Q9R0C8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms