Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AmfrQ9R049 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AmfrQ9R049 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.1 ms