Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf4Q9QZS2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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