Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a3Q9QZB6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a3Q9QZB6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms