Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo1Q9QZ11 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms