Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phtf1Q9QZ09 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phtf1Q9QZ09 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms