Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmeff2Q9QYM9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff2Q9QYM9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms