Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdzd4Q9QY39 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms