Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nufip1Q9QXX8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nufip1Q9QXX8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms