Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cbx8Q9QXV1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cbx8Q9QXV1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms