Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpsf3Q9QXK7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpsf3Q9QXK7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms