Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

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Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apbb1Q9QXJ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apbb1Q9QXJ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms