Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms