Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trpc5Q9QX29 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trpc5Q9QX29 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trpc5Q9QX29 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trpc5Q9QX29 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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