Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PolkQ9QUG2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms