Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hdgfl3Q9JMG7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hdgfl3Q9JMG7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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