Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms