Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkd2l2Q9JLG4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkd2l2Q9JLG4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms