Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms