Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gde1Q9JL56 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms