Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms