Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
AtrQ9JKK8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
AtrQ9JKK8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms