Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stx6Q9JKK1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms