Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp5Q9JKD3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp5Q9JKD3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms