Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Uchl3Q9JKB1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Uchl3Q9JKB1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms