Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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