Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Alyref2Q9JJW6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Alyref2Q9JJW6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Alyref2Q9JJW6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Alyref2Q9JJW6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Alyref2Q9JJW6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Alyref2Q9JJW6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Alyref2Q9JJW6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Alyref2Q9JJW6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alyref2Q9JJW6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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