Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfhx4Q9JJN2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfhx4Q9JJN2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfhx4Q9JJN2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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