Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1Q9JIT0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1Q9JIT0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms