Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Kcnmb4Q9JIN6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms