Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tulp4Q9JIL5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp4Q9JIL5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms