Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms