Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Copb1Q9JIF7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copb1Q9JIF7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms