Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2ird1Q9JI57 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms