Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ClpxQ9JHS4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ClpxQ9JHS4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ClpxQ9JHS4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpxQ9JHS4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ClpxQ9JHS4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ClpxQ9JHS4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ClpxQ9JHS4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ClpxQ9JHS4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpxQ9JHS4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms