Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET80

Jph1, Junctophilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph1Q9ET80 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Jph1Q9ET80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Jph1Q9ET80 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms