Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SelenofQ9ERR7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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