Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hipk3Q9ERH7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms