Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lima1Q9ERG0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lima1Q9ERG0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms