Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Wdr61Q9ERF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms