Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp4Q9ER80 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp4Q9ER80 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms