Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn12Q9ER56 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn12Q9ER56 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms