Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Barx1Q9ER42 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Barx1Q9ER42 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Barx1Q9ER42 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Barx1Q9ER42 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Barx1Q9ER42 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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