Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms