Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox9Q9EQM5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox9Q9EQM5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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