Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms