Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms