Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc97Q9DBT3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc97Q9DBT3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms