Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med27Q9DB40 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med27Q9DB40 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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