Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5oQ9DB20 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms